MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pantoea ananatis LMG 5342

Total Repeats: 80582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016816	ACT	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378764972
2	NC_016816	CAA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378764972
3	NC_016816	GTCA	2	8	265	272	25 %	25 %	25 %	25 %	378764972
4	NC_016816	GC	3	6	293	298	0 %	0 %	50 %	50 %	378764972
5	NC_016816	CCGGCA	2	12	322	333	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378764972
6	NC_016816	CCTGCG	2	12	364	375	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378764972
7	NC_016816	TAA	2	6	399	404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378764972
8	NC_016816	TTG	2	6	425	430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378764972
9	NC_016816	CG	3	6	454	459	0 %	0 %	50 %	50 %	378764972
10	NC_016816	GGC	2	6	487	492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378764972
11	NC_016816	TGCA	2	8	548	555	25 %	25 %	25 %	25 %	378764972
12	NC_016816	ATT	2	6	568	573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378764972
13	NC_016816	AAT	2	6	649	654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378764972
14	NC_016816	CGGT	2	8	682	689	0 %	25 %	50 %	25 %	378764972
15	NC_016816	CTG	2	6	697	702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764972
16	NC_016816	CAA	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378764972
17	NC_016816	CAG	2	6	787	792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764972
18	NC_016816	ATC	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378764972
19	NC_016816	GCC	2	6	888	893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378764972
20	NC_016816	TGA	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378764972
21	NC_016816	CTTT	2	8	968	975	0 %	75 %	0 %	25 %	378764972
22	NC_016816	CGCCAA	2	12	1035	1046	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378764972
23	NC_016816	CCGG	2	8	1052	1059	0 %	0 %	50 %	50 %	378764972
24	NC_016816	TTCG	2	8	1075	1082	0 %	50 %	25 %	25 %	378764972
25	NC_016816	ATA	2	6	1133	1138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378764972
26	NC_016816	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378764972
27	NC_016816	TAC	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378764972
28	NC_016816	CGCTCG	2	12	1198	1209	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378764972
29	NC_016816	ATGGCG	2	12	1228	1239	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378764972
30	NC_016816	TGG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378764972
31	NC_016816	GAA	2	6	1348	1353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378764972
32	NC_016816	AGA	2	6	1368	1373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378764972
33	NC_016816	TCA	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378764972
34	NC_016816	TTG	2	6	1422	1427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378764973
35	NC_016816	GCA	2	6	1453	1458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764973
36	NC_016816	CTG	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764973
37	NC_016816	GTT	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378764973
38	NC_016816	TGGAAA	2	12	1557	1568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378764973
39	NC_016816	CGA	2	6	1611	1616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764973
40	NC_016816	CT	3	6	1733	1738	0 %	50 %	0 %	50 %	378764973
41	NC_016816	CTA	2	6	1867	1872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378764973
42	NC_016816	ATG	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378764973
43	NC_016816	CTG	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764973
44	NC_016816	CGG	2	6	2035	2040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378764973
45	NC_016816	GCA	3	9	2067	2075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764973
46	NC_016816	CG	3	6	2081	2086	0 %	0 %	50 %	50 %	378764973
47	NC_016816	TGG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378764973
48	NC_016816	TCG	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764973
49	NC_016816	TGC	2	6	2151	2156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764973
50	NC_016816	A	6	6	2158	2163	100 %	0 %	0 %	0 %	378764973
51	NC_016816	GCG	2	6	2219	2224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378764973
52	NC_016816	CT	3	6	2228	2233	0 %	50 %	0 %	50 %	378764973
53	NC_016816	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378764973
54	NC_016816	GAA	2	6	2309	2314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378764973
55	NC_016816	CTG	3	9	2423	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764973
56	NC_016816	GTC	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764973
57	NC_016816	CTG	2	6	2673	2678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764974
58	NC_016816	TTAGCG	2	12	2712	2723	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378764974
59	NC_016816	GGCC	2	8	2825	2832	0 %	0 %	50 %	50 %	378764974
60	NC_016816	GCA	2	6	2853	2858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764974
61	NC_016816	TGC	2	6	2863	2868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764974
62	NC_016816	TCGG	2	8	2901	2908	0 %	25 %	50 %	25 %	378764974
63	NC_016816	TGC	2	6	2989	2994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764974
64	NC_016816	CGG	2	6	3035	3040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378764974
65	NC_016816	GCT	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764974
66	NC_016816	AC	3	6	3085	3090	50 %	0 %	0 %	50 %	378764974
67	NC_016816	T	7	7	3095	3101	0 %	100 %	0 %	0 %	378764974
68	NC_016816	GCG	2	6	3144	3149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378764974
69	NC_016816	GC	3	6	3230	3235	0 %	0 %	50 %	50 %	378764974
70	NC_016816	CAC	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378764974
71	NC_016816	AAAG	2	8	3333	3340	75 %	0 %	25 %	0 %	378764974
72	NC_016816	CTG	2	6	3483	3488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764974
73	NC_016816	CGC	2	6	3540	3545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378764974
74	NC_016816	TGA	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378764974
75	NC_016816	CGC	2	6	3594	3599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378764974
76	NC_016816	CTG	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764974
77	NC_016816	TGAC	2	8	3676	3683	25 %	25 %	25 %	25 %	378764974
78	NC_016816	CGA	2	6	3904	3909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764975
79	NC_016816	GACG	2	8	3980	3987	25 %	0 %	50 %	25 %	378764975
80	NC_016816	GAA	3	9	4010	4018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378764975
81	NC_016816	GT	3	6	4020	4025	0 %	50 %	50 %	0 %	378764975
82	NC_016816	CGG	2	6	4026	4031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378764975
83	NC_016816	TGC	2	6	4050	4055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764975
84	NC_016816	GAC	2	6	4073	4078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764975
85	NC_016816	GGC	2	6	4097	4102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378764975
86	NC_016816	TCG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764975
87	NC_016816	CAG	2	6	4184	4189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764975
88	NC_016816	TCCT	2	8	4343	4350	0 %	50 %	0 %	50 %	378764975
89	NC_016816	GGT	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378764975
90	NC_016816	TTG	2	6	4434	4439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378764975
91	NC_016816	AAAAC	2	10	4452	4461	80 %	0 %	0 %	20 %	378764975
92	NC_016816	CGG	2	6	4591	4596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378764975
93	NC_016816	AC	3	6	4598	4603	50 %	0 %	0 %	50 %	378764975
94	NC_016816	CCGCG	2	10	4615	4624	0 %	0 %	40 %	60 %	378764975
95	NC_016816	AAG	2	6	4656	4661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378764975
96	NC_016816	A	6	6	4670	4675	100 %	0 %	0 %	0 %	378764975
97	NC_016816	TTC	2	6	4783	4788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378764975
98	NC_016816	AGC	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764975
99	NC_016816	ATGA	2	8	4817	4824	50 %	25 %	25 %	0 %	378764975
100	NC_016816	CTG	2	6	4826	4831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764975
101	NC_016816	CTG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764975
102	NC_016816	ATT	2	6	4883	4888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378764975
103	NC_016816	CGC	2	6	4891	4896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378764975
104	NC_016816	CCG	2	6	4936	4941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378764975
105	NC_016816	GC	3	6	4947	4952	0 %	0 %	50 %	50 %	378764975
106	NC_016816	TGG	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378764975
107	NC_016816	GCGG	2	8	5042	5049	0 %	0 %	75 %	25 %	378764975
108	NC_016816	CAAG	2	8	5056	5063	50 %	0 %	25 %	25 %	378764975
109	NC_016816	CAT	4	12	5236	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378764975
110	NC_016816	CTG	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764975
111	NC_016816	CTT	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378764975
112	NC_016816	GCC	2	6	5353	5358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378764975
113	NC_016816	A	6	6	5372	5377	100 %	0 %	0 %	0 %	378764975
114	NC_016816	TGC	2	6	5415	5420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764975
115	NC_016816	ACC	2	6	5462	5467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378764975
116	NC_016816	GGC	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378764975
117	NC_016816	AGA	2	6	5532	5537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378764975
118	NC_016816	CGT	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764975
119	NC_016816	TGC	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764975
120	NC_016816	AC	3	6	5598	5603	50 %	0 %	0 %	50 %	378764975
121	NC_016816	GGC	2	6	5834	5839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378764975
122	NC_016816	GAA	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378764975
123	NC_016816	CAG	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764975
124	NC_016816	CTGG	2	8	5926	5933	0 %	25 %	50 %	25 %	378764975
125	NC_016816	AGC	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764975
126	NC_016816	ACC	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378764975
127	NC_016816	GCC	2	6	6030	6035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378764975
128	NC_016816	GCC	2	6	6068	6073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378764975
129	NC_016816	CAC	2	6	6085	6090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378764975
130	NC_016816	CCGCG	2	10	6113	6122	0 %	0 %	40 %	60 %	378764975
131	NC_016816	GCT	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378764976
132	NC_016816	GCA	2	6	6410	6415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764976
133	NC_016816	AAT	2	6	6564	6569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378764976
134	NC_016816	TCA	2	6	6581	6586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378764976
135	NC_016816	ATT	2	6	6634	6639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378764976
136	NC_016816	CAAA	2	8	6712	6719	75 %	0 %	0 %	25 %	378764976
137	NC_016816	AGCC	2	8	6746	6753	25 %	0 %	25 %	50 %	378764976
138	NC_016816	AGA	2	6	6785	6790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378764976
139	NC_016816	TGA	3	9	6820	6828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378764976
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141	NC_016816	TTA	2	6	6914	6919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378764976
142	NC_016816	TGGCG	2	10	7058	7067	0 %	20 %	60 %	20 %	378764976
143	NC_016816	GCAAT	2	10	7072	7081	40 %	20 %	20 %	20 %	378764976
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147	NC_016816	TGGC	2	8	7357	7364	0 %	25 %	50 %	25 %	378764977
148	NC_016816	CCAG	2	8	7397	7404	25 %	0 %	25 %	50 %	378764977
149	NC_016816	GC	3	6	7466	7471	0 %	0 %	50 %	50 %	378764977
150	NC_016816	ACGTT	2	10	7509	7518	20 %	40 %	20 %	20 %	378764977
151	NC_016816	TCA	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378764977
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154	NC_016816	AGC	2	6	7805	7810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764977
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156	NC_016816	GATCA	2	10	7885	7894	40 %	20 %	20 %	20 %	378764977
157	NC_016816	GGAT	2	8	7912	7919	25 %	25 %	50 %	0 %	378764977
158	NC_016816	AGC	2	6	8089	8094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378764977
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162	NC_016816	ACA	2	6	8360	8365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378764977
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164	NC_016816	GTT	2	6	8508	8513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378764977
165	NC_016816	TGGGC	2	10	8539	8548	0 %	20 %	60 %	20 %	378764978
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168	NC_016816	GC	3	6	8601	8606	0 %	0 %	50 %	50 %	378764978
169	NC_016816	TAG	2	6	8640	8645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378764978
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254	NC_016816	T	6	6	14150	14155	0 %	100 %	0 %	0 %	378764984
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